然而，學術查重不是能識別全部的參考文獻，僅有有些相符格式的參考文獻才會學術識別，這也就說明僅有當參考文獻格式正規且正確的時候，學術才能將該部分參考文獻排出在查重范疇以外。所以，能肯定的說，學術查重不包括格式正確的參考文獻。另一方面，怎么學術查重報告中一些時候會將參考文獻標紅呢？這里有以下兩個緣由，即一是有可能論文筆者選用了非正規的學術查重系統對文章進行查重，而這種非正規的學術查重系統并非正規的學術查重，因此不能識別參考文獻，引發參考文獻標紅；二是論文的參考文獻格式不正確，引發學術查重系統不能識別該部分參考文獻，進而將該參考文獻標紅，事實上，若該部分參考文獻格式正確就會學術查重識別，進而不會納入查重范疇之中。
綜上，學術查重并不包括參考文獻，學術查重一般而言只針對論文的綱要部分、外語綱要部分、正文部分及附錄部分進行查重，而參考文獻并不會在學術查重范疇之中。
所以，論文筆者不用憂心因需要用到羅列非常多的參考文獻在論文中。
但，唯有專業的學術才會識別參考文獻，除此之外其有一個前置性條件是參考文獻格式正確，這也說明論文筆者肯定到學術不端網的“學術查重入口”等專業的學術查重平臺進行查重，且要根據要求創寫參考文獻，保障學術能識別。
