會查的。
目錄是由正文里的標題產生的，查正文的時候會查標題；
參考文獻重復一些是沒問題的，不能重復太多，比如90%都一樣就不行。
查重的學術不端檢測理論上是查正文，不過，系統并不智能，同樣的文章不同次檢測結果也不同。有時候，論文封面的標準格式、頁碼、參考文獻、致謝、個人簡歷、在學期間學術成果等頁面也會被查重，計入重復率百分比。所以，學校還要求大家對查重結果做說明，說明這些是非正文，不涉及學術觀點
首先可以明確清楚的是，碩士論文的正文是必查部分，除此之外，碩士論文內容的查重范圍還包括有論文封面、聲明、摘要、致謝、參考文獻和論文附錄等，如果將論文的開題報告也上傳了的話，也是會進行重復率檢測的。
對于碩士論文來說，檢測碩士論文重復率最準確的論文查重系統是學術VIP論文查重系統，學術的數據庫比對查重范圍由以下數據庫構成：中國學術期刊網絡出版總庫、中國博士學位論文全文數據庫/中國優秀碩士學位論文全文數據庫、中國重要會議論文全文數據庫、中國重要報紙全文數據庫、中國專利全文數據庫、學術論文聯合比對庫、互聯網資源、英文數據庫、港澳臺學術文獻庫、優先出版文獻庫、圖書資源、個人比對庫和學術論文聯合比對庫等。
做標記的地方應該就不算了吧。
參考文獻應該不算，因為提供的參考文獻主要用于確定正文中重復的地方是否屬于引用。
