相較于本科畢業論文而言，碩士畢業論文是100%需要通過學術查重的，一般而言，各校關于碩士畢業論文的查重率規定雖有所不同，但基本上都規定查重率不得超過10%-20%，這也意味著碩士畢業論文的學術查重率必須要更為嚴格的控制。 學術VIP5.3系統雖然較之于以前的學術查重系統進行了升級，但是其重復率計算規則仍然是按照連續十三字符以上重復計算為重復部分，這也意味著學生可以巧妙的利用該規則避免重復。
碩士畢業論文查重一般要求的高一點，有的學校甚至要求3%內，并且還有單章復制比要求！ ！ ！ 1、大部分高校要求碩士論文的字數通常是在3萬字以上，要求比較嚴格的會在7萬字以上，并會規范論文的格式要求，原因之一就是為了論文檢測時的結果能夠準確無誤。
碩士要求的重復率一般不會高于20％，如果大于或者等于20％，小于30％者，疑似存在學術不端行為，取消優秀學位論文評選資格，限期修改進行復檢。 初檢的重復率如果大于或等于30％，之后復檢大于或等于20％者，可能會被取消本次學位論文答辯資格。 結果在35％以上的同學，直接延期答辯，需要對論文重新進行修改。
在一篇學術論文當中，會出現相關重復率，并不一定代表寫論文的人就做過抄襲的主動，誠然，一篇畢業論文的課題在網上有很多參考模板，只是，即使不主動去抄襲，里面的內容也有可能會出現大面積的重復，畢竟，同一個專業，專業上的術語，函數公式這些專業元素，肯定會出現雷同部分，因此，論文查重的主要作用就是，幫助畢業生勾勒出一篇論文當中與其它論文里的重復語句、段落，讓畢業生進行相關調整，只要重復率達標，后續的答辯等問題，就不會太大。 論文是影響畢業生畢業的最后一個關卡，論文過不了關，畢業問題也會因此而受阻。 針對論文重復率查重的這個問題，全國各個高校的導師對此要求很嚴格，有些學院會指定學生到相關論文檢測機構進行權威而專業的檢測，再授意學生根據論文檢測報告進行降重、改重方面的處理。
