值得一提的是，在“不合格論文”中，有部分論文是被專家直接判定為“完全不符合要求”的論文，即無論是從選題還是研究方法、論文的撰寫等方面，都不滿足碩士論文的基本要求，這些論文無一例外都是由作者學術態度和學術行為不端正所導致的。. 專家評語如“論文的工作量明顯不太夠，沒有對所提算法進行復雜性分析，更沒有跟其他相關算法進行性能比較。. （理學）”“論文中的2.2 節、2.3節的相關理論基本照搬網絡上的內容。.
1、學術碩士論文查重是全文上傳，格式對檢測結果可能會造成影響（影響很小，不會超過5%），需要將最終交稿格式提交檢測，將影響降到最小，對于3萬字符以上的論文格式的影響是可以忽略的。需要注意的是，一般重復率指的是正文，摘要、目錄、參考文獻只要格式正確檢測系統會自動刪除。此外，段落標題以及圖表標題是會算重復的。至于論文致謝，有人說也要檢測，有人說不用檢測，具體要問導師，不過致謝部分應該沒人會抄襲吧。 2、上傳論文后，系統會自動檢測該論文的章節信息，如果有自動生成的目錄信息，那么系統會將論文按章節分段檢測，否則會自動分段檢測。整篇的結果是用你重的字符數比上你全篇的字符數 每一章節的重復率是用這章重的字符數比上這一章的總字符數
研究重點不突出。 即論文論述沒有突出研究重點，缺乏問題意識，研究問題不明確，對論文觀點缺乏提煉等。 專家評語如“缺乏嚴密的邏輯推導。 （法學）”“論證單薄，論文許多部分論證不到位，淺談輒止。 （教育學）”“論文的主要內容缺少合理的理論框架，顯得較混亂。 （歷史學）”“文章在內容和結構上嚴重地偏離了自己的主題。 （文學）” 研究方法單一或不恰當。 即由于論文選用研究方法較少，實驗設計不科學，未使用該論題學科領域的研究方法和分析手段等原因，沒有運用正確的方法對研究對象進行客觀研究，體現不出作者的專業水平和研究能力，從而影響結論的有效性和可靠性。 數據不夠真實有效。 即論文所運用的數據資料的可靠性和真實性不足；數據選取不科學，甚至選取錯誤。 樣本選取的科學性不足。
從被抽檢的碩士學位論文中我們發現：不合格論文普遍有6個問題 1 1.分析問題和解決問題的能力不足 2 2.研究方法的科學性不足 3 3.學科基礎知識的系統性和扎實性不足 4 4.論文結構不嚴謹 5 1.格式不規范 6 2.語言不規范 7 3.引證不規范 8 1.參考的文獻數量不足 9 2.文獻綜述撰寫水平較低
