一、檢測速度的比較PaperYY官網介紹是這樣說的“擁有海歸博士多年研發基于大數據指紋比對算法，相比常規比對速度提升10倍，在保證查重質量的情況下，幾秒鐘就可以出查重結果”。而學術查重快者半小時，慢的幾個小時。學術查重到底多久具體可以參考《學術查重一般需要檢測多長時間》。
另外PaperYY不支持PDF查重，上傳文檔格式僅限于doc，docx，txt格式。二、檢測規則原理的比較學術是連續13字符相似即被系統判斷為重復，并且學術系統存在閥值5%，同篇文章同時檢測也會有誤差。PaperYY的檢測規則原理目前官網尚未明確說明，只給出這樣一句話“四位海歸博士，鉆研文章指紋對比技術多年，在大數據云基礎上，獨創分類比對技術，準確率高達90%以上，預處理指紋技術，秒級響應，讓檢測查重不止是準確”但是和學術比較肯定是有差別的，中國學術是國家的，因為學術檢測原理那是中國學術發明的專利并且還獲得過科技進步獎！三、系統功能的比較PaperYY有自建對比庫，檢測查重效果更上一層樓，另外PaperYY有自動降重和人工降重服務。
而學術就沒有這么人性化的服務。對于自動降重的軟件也有很多，在學術不端網的《論文降重修改軟件匯總》有詳細介紹，不過筆者還是推薦PaperEasy的人工降重服務。四、收費標準的比較PaperYY目前收費為1元10000字，有的同學也會發現其二級域名退出的是完全免費！而學術不支持個人用戶注冊賬號，學生只能到圖書館進行查重，圖書館要么是收費要么就是限制次數檢測。
很多人在進行論文查重的時候都會覺得學術太貴了，所以專門去找一些免費的網站，可能免費的網站付出的代價會更加的慘痛，所以是不建議大家去選擇的，但是大家可以選擇一些相對來說比較便宜的其他的網站，最后再用學術查重，這樣也是能省下不少錢。相關內容大家可以去《“學術論文查重”的價格差別為什么這么大？》一文了解看看。
