Paper系列和維普查重系統功能、使用范圍、檢測范圍、檢測原理等方面都有著很大區別。 假設學校是維普查重，那么paperok等其他系列的查重軟件也只能做初稿檢測參考。 paper系列因為其閥值比維普偏高，很多其實不相似的內容都會標紅，題目、目錄、參考文獻這些本身在學術一般都會自動識別到，而系列卻統統標紅導致重復率過高，從而讓我們覺得系列檢測比維普嚴格的假象，系列檢測重復率虛高的假象背后嚴格并不是準確。
第二，維普查重使用的是關鍵詞識別技術，也就是說，即使文章作者的部分語句是自己原創的，但是只要其關鍵詞和其他文章的關鍵詞重復，維普查重也可能會自動識別該部分為疑似剽竊部分，這也是為什么諸如法學、經濟學等文章使用維普查重重復率高的原因所在。 關鍵詞識別技術雖然能夠在很大程度上識別大部分抄襲，但是也有可能會將作者的原創誤判為疑似剽竊部分，該計算規則相較于學術而言就更為嚴苛和不合理，這也是為什么大部分高校或者雜志社不適用維普查重的原因之一。
